1930年8月，河南中山大学校务会议决定，将河南中山大学改名为河南大学，呈民国河南省政府核示。同年9月7日，河南省第三届议会议决，批准将河南中山大学改名为河南大学。同月13日，河南省政府颁发河南大学印章及校长职章。从此，河南大学正式命名，张仲鲁仍任校长。
1930年公布的《省立河南大学组织大纲》中说：“本大学定名为河南大学……本大学以研究高深学术、养成建设人才、实现三民主义为宗旨。”办学经费来源以省政府拨款、校产收入为主，还有私人或团体捐款。河南大学命名之后，将过去的文、理、农、法、医5科改为5个学院，学院下设系。文学院设国文学系、英文学系、史学系、教育学系、社会学系；理学院设算学系、物理学系、化学系、生物学系；农学院设农艺系、园艺系、林学系、畜牧学系，并设农事试验场及农业推广部；法学院设政治系、法律系、经济系；医学院暂不分系。
河南大学设校长1人，总理全校校务。设教务长（又称校务主任）1人，辅佐校长办理全校事宜，校长外出时代行校长职务。学校的行政机构设校长室、教务处、事务处和图书馆。其职责为：校长室（设秘书1至2人），处理文书事宜；教务处（设主任1人），辅佐校长处理注册、印刷、体育等事宜；事务处（设主任1人），辅佐校长处理庶务、斋务、会议等事宜；图书馆（设主任1人），会同各学院院长辅佐校长处理图书事宜。各学院设院长1人，分别处理各学院事宜。学校设校务会和经济监察委员会，集体决议学校重大事项。
河南大学当时有教职员123人，其中教授52人，副教授2人，讲师1人，助教14人，体育教育及军事教官4人，职员35人，兼职教员15人。有学生820人，其中本科生370人，预科生450人（女生40余人），此外尚有各附属学校学生。
1930年秋河大开学。张仲鲁校长在露天广场对教职员及学生讲话，宣布预先拟定的河南大学五年发展规划，决心使学校再上一个新的台阶。中原大战冯玉祥失败后，张仲鲁不被当局认可，于同年10月即被免去校长职务（1931年又到焦作任焦作工学院院长）。张仲鲁去职后，1930年10月由校务主任兼理学院院长赵新吾（号维汉）代理校长。赵新吾代理校长仅2个月时间，1931年1月由李敬斋兼任校长（李敬斋曾于1918~1919年任预校校长）。李敬斋兼任校长仅5个月时间，到1931年5月，即由许心武接任校长。
鉴于学校仅有一大席棚作为集会活动场所，雨雪天不能使用，身为建筑学家的许心武校长于是提出建筑大礼堂的动议，得到大家的赞同与支持。为精心建好大礼堂，学校聘请本校教师李敬斋、杜岫僧、瞿茀章等11人组成“大礼堂建筑委员会”。大礼堂于1931年11月20日破土动工，至1934年12月28日落成。
1931年，许心武校长恢复了已停办4年的河南大学附中。附中教师绝大多数由河南大学各学院的教授、副教授以及能力强的讲师兼任，因此教学质量甚高，第一届毕业生升入大学者达95%以上。原国家经委副主任、中国人民大学校长袁宝华，原卫生部副部长李欣，原国家体委副主任张福垢等都是当年附中的毕业生。
1931年5月，在许心武校长主持下，开始筹建土木工程系，当年秋季开学。许心武校长在政务繁忙的情况下，亲自讲授水文学、大地测量及砖石结构学3门课。他尊师敬贤，延揽了一批国内知名学者莅校任教，使河南大学在20世纪30年代进入了兴旺发达期。后因河大附中学生参加抗日救亡活动，附中要开除进步学生的学籍，许校长坚持异议愤然于1933年8月辞去校长职务。
1933年8月，张仲鲁第二次出任河南大学校长。他的一系列改革措施遭到了国民党军统分子的反对和干扰，因此壮志未酬。1934年，张仲鲁电告河南省政府主席刘峙辞去校长职务，并荐河大教务长许蓬熙代理，刘峙批示同意，后因某种原因又改以杜俊代理河大校长。
1935年4月杜俊辞职，由杨震文担任河大校长。杨任河大校长后，因派系纷争愈演愈烈，自1935年4月至6月仅3个月时间，学校就出现了不少困难。后来他被迫辞职，由刘季洪接任校长。
