《河南大学学报(自然科学版)》在蝉联5届河南省优秀科技期刊称号的基础上，把荣誉当作新的起点，坚持不懈抓质量，聚精会神做编校。2006年底，根据新的《期刊出版管理规定》，河南省新闻出版局组织了首届河南省自然科学期刊编校质量抽查，《河南大学学报(自然科学版)》编校质量在同类期刊中名列前茅；最近在中国科学院文献情报中心中国科学引文数据库每两年一次遴选评价中，依据文献计量学的理论和方法，通过定量与定性相结合的综合评审，《河南大学学报(自然科学版)》以同类期刊中的优秀期刊被收录为中国科学引文数据库来源期刊，并颁发了收录证书。中国科学引文数据库(CSCD)此次评选进行了较大的动态调整，收录期刊总数为1082种。全国高校综合类自然科学学报仅收录50余家，河南省仅有2家。2000年以来，《河南大学学报(自然科学版)》质的提高进入了稳定发展期，量的增长实现了从季刊到双月刊历史性的跨越。
近几年来，在校党委、校行政的正确领导下，学报科技编辑人员齐心协力，狠抓学术质量和编排规范化，促进了整体水平的提高。1996年以来，连续五届蝉联河南省优秀科技期刊奖；在2000年，荣获了全国学术期刊规范执行优秀奖；同年，以学术质量的优势，被中国科学引文数据库(CSCD)选定为来源期刊；在中国科技信息所发布的2002年版《中国科技期刊引证报告》(CJCR)中显示，《河南大学学报(自然科学版)》的影响因子和被引频次在同类期刊排序中，均居我省同类科技期刊榜首。2003年，《河南大学学报(自然科学版)》入选中国科技核心期刊；2004年，被评为全国中文核心期刊；2004 年9月，荣获全国高校优秀科技期刊一等奖,也是《河南大学学报(自然科学版)》创刊以来首次获得的全国性期刊奖。
在科技期刊国际化方面，学报重视同国际有关检索机构的交流与沟通，从2001年起，《河南大学学报(自然科学版)》被美国的《化学文摘》（CA）和俄罗斯文摘杂志（AJ）正式收录；2006年，又与高等教育出版社学术期刊中心签订了合作协议，发表的优秀论文可转载直接进入Springer数据库。这对我校学术成果的国际交流具有积极意义。
